Η πλέον γνωστή και απόλυτα τεκμηριωμένη δράση της πρόπολης είναι η αντιμικροβιακή, μυκοστατική καθώς και η δράση της εναντίον ιών (Lindenfelser 1967, Ghisalberti 1979, Grange & Davey 1990, Hegazi et al 2000, Sforcin et al 2000).
Επίσης έχει τεκμηριωθεί ότι η πρόπολη δρα εναντίον ελκών (π.χ. έλκη στομάχου) ενισχύει το ανοσοποιητικό σύστημα και έχει κυττοστατική δράση και αντι-υπερτασικές ιδιότητες (Banskota 1 al. 2001).
Στην αντιμικροβιακή της ειδικότερα δράση οφείλεται η ταρίχευση μεγαλόσωμων εχθρών του μελισσιού (ποντίκια, νυχτόβιες πεταλούδες), τους οποίους οι μέλισσες κεντρίζουν και θανατώνουν μέσα στην κυψέλη, αλλά αδυνατούν να απομακρύνουν από εκεί τα πτώματά τους.